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    干貨分享--WB實(shí)驗問(wèn)題總結與處理方案(三)

    日期:2021-07-27瀏覽:9330次

    41、跑電泳的時(shí)候配的膠總是“縮"是什么原因呢?是有的成分不對嗎?

    答:沒(méi)什么問(wèn)題,就是你膠里的水分被蒸發(fā)了。過(guò)夜時(shí)拿保鮮膜包起來(lái),在里面加點(diǎn)水保持濕度就可以了;也可能母液(30%聚丙酰胺)有問(wèn)題,你可以重新配制一份觀(guān)察;能夠替換的試劑,盡量換一下,選用好的試劑。

     

    42、蛋白質(zhì)的分子量跨度很大,如要分離小21KD,中至66KD,大至170KD,可以一次做好嗎?

    答:這么廣的分布不好轉移,一般建議:21kd66kd可以一起轉,12SDS-PAGE, 濕轉120mA, 45-60min就可以了, 可以根據你實(shí)驗室的經(jīng)驗調節;170kd 7%SDSPAGE,200mA 90-120min。

     

    43、不能很好地將大分子量蛋白轉移到膜上, 轉移效率低怎么樣解決?

    答:可以考慮:轉移緩沖液中加入20%甲醇(是指終濃度),因為甲醇可降低蛋白質(zhì)洗脫效率,但可增加蛋白質(zhì)和PVDF膜的結合能力,甲醇可以防止凝膠變形,甲醇對高分子量蛋白質(zhì)可延長(cháng)轉移時(shí)間;轉移緩沖液加入終濃度0.1%SDS,也是為了增加轉移效率;用優(yōu)質(zhì)的轉移膜,或使用小孔徑的PVDF膜(0.2微米)。

     

    44、我用的是可視marker,但是電泳總跑不全8條帶,請問(wèn)什么原因?怎樣改善?膠用過(guò)8%,10%,12%,都是這樣。marker是新買(mǎi)的。

    答:一般來(lái)說(shuō),是小分子量Marker跑走了,增加膠濃度或減少電泳時(shí)間試試看。當然梯度膠也是不錯的選擇。

     

    45、是否Western Blot實(shí)驗半定量一定要加ACTIN內參?

    答:半定量實(shí)驗需要有內參。

     

    46、核內抗原Western Blot內參選擇什么合適?

    答:可以選用組蛋白,組蛋白在細胞核中的表達是很穩定的,有很多都可以當成內參,在網(wǎng)上查查就可以選出你要的內參。

     

    47、做半定量Western Blot,內參β-actin,GAPDH哪個(gè)好?

    答:兩者均可。

     

    48、想問(wèn)一下細胞裂解液選擇蛋白酶抑制劑時(shí)有什么原則嗎?受不受組織來(lái)源的影響?胞膜和胞漿有區別嗎?

    答:一般來(lái)說(shuō)提取時(shí)加入廣譜的蛋白酶抑制劑就可以了,操作時(shí)保持低溫。除非有文獻特別指明用特殊的方法,一般來(lái)說(shuō)都沒(méi)有區別。

     

    49、轉膜后的脫脂奶粉封閉液是5%TBST脫脂奶粉",其中TBST最后那個(gè)TTween嗎,濃度多大?

    答:是Tween,配方如下:Tris-Buffered Saline Tween-20 (TBST), NaCl8g, Tris base2.42g 加水 800ml溶解, 500-1000ul Tween-20, HCl 調節pH 7.4, 加水定容至 1L。

     

    50、封閉,一抗,二抗時(shí)的溫度有沒(méi)有什么規定呢,比如在室溫里做,或者要在4度下?

    答:均可在室溫進(jìn)行,如果時(shí)間不夠,一抗孵育可以先在室溫進(jìn)行一個(gè)小時(shí),然后4度過(guò)夜。

     

    51、請問(wèn)一下PVDF膜和硝酸膜結合蛋白的原理是什么?

    答:一般而言,硝酸纖維素膜是通過(guò)疏水作用來(lái)和蛋白質(zhì)相聯(lián),這樣的話(huà),反復洗幾次后,蛋白容易掉下來(lái),結果較差。PVDF膜主要通過(guò)它膜上的正電荷和蛋白接合,同時(shí)也有疏水作用,但相對較弱。這樣的話(huà),PVDF膜和蛋白接合較牢,不易脫落,結果較好。

     

    52、怎樣才能把膠跑的非常漂亮,泳道都能很直,上樣的量和灌膠是否很重要,電壓有什么要求?

    答:影響跑膠跑的質(zhì)量,有以下幾個(gè)因素:

    1)電壓,小的電壓會(huì )使膠的分子篩效應得到充分發(fā)揮。電壓越小,條帶越漂亮,濃縮膠55v,分離膠75v就能跑得很好。

    2)膠的均勻度,膠越均勻,條帶越窄,分離越均勻。倒膠之前,一定要充分混勻,玻璃板一定要干凈,雙蒸水隔離時(shí),一定要比較輕地加上去,避免稀釋上層的分離膠.

     

    53、為什么提高大分子量蛋白的轉移的時(shí)候,小分子量蛋白會(huì )丟失一些哪?什么原因?

    答:小分子的蛋白在轉移過(guò)程中,會(huì )透過(guò)膜去,所以大分子的上去以后,有一部分小分子的就透過(guò)去了。

     

    54.電泳中常出現的一些現象:

    ●︶ 條帶呈笑臉狀

    原因:凝膠不均勻冷卻,中間冷卻不好; 電泳系統溫度偏高。

    ●︵ 條帶呈皺眉狀

    原因:可能是由于裝置不合適,特別可能是凝膠和玻璃擋板底部有氣泡,或者兩邊聚合不*。

    ●拖尾

    原因:樣品溶解不好。

    ●紋理(縱向條紋)

    原因:樣品中含有不溶性顆粒。

    ●條帶偏斜

    原因:電極不平衡或者加樣位置偏斜。

    ●條帶兩邊擴散

    原因:加樣量過(guò)多。

     

    55Western blot結果中背景較高

    可能的原因及建議:

    ●膜封閉不夠

    延長(cháng)封閉的時(shí)間;選擇更加適合的封閉液。

    ●一抗稀釋度不適宜

    對抗體進(jìn)行滴度測試,選擇最適宜的抗體稀釋度。

    ●一抗孵育的溫度偏高

    建議4℃結合過(guò)夜。

    ●選擇的膜容易產(chǎn)生高背景

    一般硝酸纖維素膜的背景會(huì )比PVDF膜低。

    ●膜在實(shí)驗過(guò)程中干過(guò)

    實(shí)驗過(guò)程中要注意保持膜的濕潤。

    ●檢測時(shí)曝光時(shí)間過(guò)長(cháng)

    減少曝光時(shí)間。

     

    56Western blot結果中雜帶較多

    可能的原因及建議:

    ●目的蛋白有多個(gè)修飾位點(diǎn)(磷酸化位點(diǎn)、糖基化位點(diǎn)、乙?;稽c(diǎn)等),本身可以呈現多條帶。

    查閱文獻或進(jìn)行生物信息學(xué)分析,獲得蛋白序列的修飾位點(diǎn)信息,通過(guò)去修飾確定蛋白實(shí)際大小。

    ●目的蛋白有其它剪切本

    查閱文獻或生物信息學(xué)分析可能性。

    ●樣本處理過(guò)程中目的蛋白發(fā)生降解

    加入蛋白酶抑制劑;樣本處理時(shí)在冰上操作。

    ●上樣量過(guò)高,太敏感

    適當減少上樣量。

    ●一抗特異性不高

    重新選擇或制備高特異性的抗體。

    ●一抗不純

    純化抗體

    ●一抗或者二抗濃度偏高

    降低抗體濃度。

     

    57 . Western blot結果中無(wú)信號或顯示信號弱

    可能的原因及建議:

    ●檢測樣本不表達目的蛋白

    選擇表達量高的細胞作為陽(yáng)性對照,用于確定檢測樣本是否為陰性。

    ●檢測樣本低表達目的蛋白

    提高上樣量,裂解液中注意加入蛋白酶抑制劑。

    ●轉移不*或過(guò)轉移

    可以用麗春紅染膜并結合染膠(考馬斯亮藍)后確定條帶是否轉至膜上或轉移過(guò)頭;適當調整轉膜的時(shí)間和電流。

    ●抗體不能識別測試種屬的相關(guān)蛋白

    購買(mǎi)抗體前應當認真閱讀抗體說(shuō)明書(shū),確定其是否能夠交叉識別測試種屬的對應蛋白。

    ●一抗孵育時(shí)間不足

    建議4℃結合過(guò)夜。

    ●二抗與一抗不匹配

    選擇針對一抗來(lái)源的種屬的抗體。

    ●洗膜過(guò)度

    洗膜時(shí)間不宜過(guò)長(cháng),加入的去垢劑不宜過(guò)強或過(guò)多,建議使用0.1%的弱去垢劑Tween-20。

     

    58. 其它現象:

    ●膜上多處出現黑點(diǎn)或黑斑

    原因:抗體與封閉試劑發(fā)生非特異性的結合。

    ●反白(條帶顯白色)

    原因:目的蛋白含量太高或者一抗濃度偏高。

    ●蛋白分子量偏低或偏高

    原因:膠濃度不適合,高分子量要用低濃度膠;小分子蛋白要用高濃度膠。

     

    59.安全問(wèn)題:

    操作有毒試劑時(shí),帶手套,且操作揮發(fā)性試劑應在通風(fēng)櫥中進(jìn)行。


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