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日期:2021-07-21瀏覽:1824次
簡(jiǎn)介
聚合酶鏈式反應(PCR)是一種用于放大擴增特定的DNA片段的分子生物學(xué)技術(shù),它可看作是生物體外的特殊DNA復制,PCR的最大特點(diǎn)是能將微量的DNA大幅增加。PCR的發(fā)明者凱利·穆利斯(Kary.B.Mullis)于1993年與邁克爾·史密斯分享了諾貝爾化學(xué)獎。
PCR反應過(guò)程
聚合酶鏈反應是在一個(gè)反應混合物中進(jìn)行的,該反應混合物包括DNA提取(模板DNA)、Taq聚合酶、引物,以及在緩沖溶液中過(guò)量的四種脫氧核糖核酸苷三磷酸鹽(dNTPs)。PCR的三步驟為變性---退火---延伸。
①模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至94℃左右一定時(shí)間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結合,為下輪反應做準備;
②模板DNA與引物的退火(復性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結合;
③引物的延伸:DNA模板--引物結合物在Taq酶的作用下,以dNTP為反應原料,靶序列為模板,按堿基配對與半保留復制原理,合成一條新的與模板DNA 鏈互補的半保留復制鏈。
重復循環(huán)變性--退火--延伸三過(guò)程,就可獲得更多的“半保留復制鏈",而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個(gè)循環(huán)需2~4分鐘, 2~3小時(shí)就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬(wàn)倍。
臨床應用
PCR在醫學(xué)檢驗學(xué)中最有價(jià)值的應用領(lǐng)域就是對感染性疾病的診斷。理論上,只要樣本有一個(gè)病原體存在,PCR就可以檢測到。一般實(shí)驗室也能檢出10~100基因拷貝,而目前病原體抗原檢測方法一般需要105-7個(gè)病原體才可檢測到。PCR對病原體的檢測解決了免疫學(xué)檢測的“窗口期"問(wèn)題,可判斷疾病是否處于隱性或亞臨床狀態(tài)。此次武漢新型肺炎中“核酸檢測"所使用到的就是基于PCR法的實(shí)時(shí)熒光定量PCR(real-time PCR)技術(shù)。
在許多腫瘤早期和良性的階段,癌基因的表達改變以及突變就已經(jīng)出現,PCR技術(shù)不但能有效的檢測基因的突變,而且能準確檢測癌基因的表達量,可據此進(jìn)行腫瘤早期診斷、分型、分期和預后判斷。而在腫瘤的個(gè)體化用藥中,《個(gè)體化醫學(xué)檢測質(zhì)量保證指南》中提到的幾大類(lèi)檢測方法中,如Sanger測序法、焦磷酸測序法、NGS、ARMS-PCR法、HRM法,數字PCR法,熒光定量PCR法都是基于PCR法發(fā)展的新型技術(shù)。
在遺傳病方面,PCR技術(shù)的臨床應用就是從檢測鐮狀細胞和β-地中海貧血的基因突變開(kāi)始的。
PCR是一種現在在細胞和分子生物學(xué)中使用普遍的技術(shù)。它允許,特別是在幾個(gè)小時(shí)內,通過(guò)自動(dòng)化系統“非細胞克隆"DNA片段,這通常需要幾天的標準技術(shù)的分子克隆。另一方面,PCR被廣泛用于診斷目的,以檢測特定的DNA序列的存在這個(gè)或那個(gè)生物體在生物液體。它還被用來(lái)制作遺傳指紋,無(wú)論是在司法調查中對一個(gè)人的遺傳鑒定,還是對動(dòng)物品種、植物或微生物進(jìn)行食品質(zhì)量檢測、診斷或品種選擇的鑒定。PCR仍然是進(jìn)行測序或定點(diǎn)突變所必需的。另外還有一些關(guān)于PCR技術(shù)改良的報道例如金屬有機框架輔助的高效聚合酶鏈式反應。
PCR變體
最后簡(jiǎn)單介紹一下PCR的變體,如real-time PCR, competitive PCR, PCR in - situ, RT-PCR等。
遞減PCR(touchdown PCR):前幾循環(huán)溫度逐漸下降。
逆轉錄PCR(RT-PCR):以由mRNA逆轉錄而來(lái)的cDNA為模板,也因為是從表現型基因來(lái)進(jìn)行增量的,由此產(chǎn)生出來(lái)的cDNA產(chǎn)物不帶有內含子(基因中不具意義的段落),常應用于分子克隆技術(shù)。
熱啟動(dòng)PCR(hot start PCR):以高熱激活型核酸聚合酶進(jìn)行反應,減少非專(zhuān)一性產(chǎn)物。
實(shí)時(shí)熒光定量PCR(real-time PCR):PCR過(guò)程中利用螢光探針或染料定量檢測,又稱(chēng)定量PCR(quantitative PCR),可以進(jìn)行多組對比。此次武漢新型肺炎中“核酸檢測"所使用到的關(guān)鍵技術(shù)
巢式PCR(nested PCR):先用低特異性引物擴增幾個(gè)循環(huán)以增加模板數量,再用高特異性引物擴增。
多重PCR(multiplex PCR):在同一個(gè)管中使用多組引物。
復原條件PCR(reconditioning PCR):PCR產(chǎn)物稀釋10倍后重新放入原濃度的引物和dNTP等循環(huán)3次,以消除產(chǎn)物中的異二聚體。
dsRNA合成(dsRNA replicator):合并使用high-fidelity DNA polymersae、T7RNA聚合酶與Phi6 RNA replicase;從雙股DNA轉錄為對應的雙股RNA(dsRNA)??蓱糜?/span>RNAi實(shí)驗操作。
COLD-PCR(co-amplification at lower denaturation temperature-PCR):用以檢測突變或特殊等位基因的PCR應用技術(shù)。
Digital-PCR:將標準的PCR反應分割至每一個(gè)反應中僅1~2個(gè)copy。藉以偵測微小比例的基因差異。應用于:病原體檢測、癌癥突變基因、借由母血對胎兒做產(chǎn)前檢測。
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